オズの魔女たちの知られざる物語が壮大な結末を迎える。"西の悪い魔女"として悪名を着せられ、逃亡生活を送りながら真実のために闘うエルファバ。その一方で、"善い魔女"グリンダはエメラルドシティを治めるが、怒りに駆られたオズの住人が"悪い魔女"を追い詰めていく。自分自身と世界そのものを永遠に変えるために、2人は再び手を取り、互いに向き合うことに。